طراحی واکسن in silico
طراحی واکسن از مهمترین بخش های تحقیقاتی و صنعتی در بیوتکنولوژی محسوب می شود. طراحی واکسن به صورت in silico پس از همگیری کرونا ویروس اهمیت بالایی پیدا کرده است. طراحی واکسن in silico اولین مرحله در صنعت واکسن سازی می باشد.
واکسن یک فراورده زیستی است که در برابر یک بیماری میکروبی، انگلی و یا بیماری های مضمن مثل سرطان، ایمنی فعالِ اکتسابی تولید میکند.
در گذشته واکسن ها را از میکروب های کشته شده و یا ضعیف شده تهیه می کردند. در شرایط کنونی با توسعه تکنیک های توالی یابی و همچنین ایجاد دانش هایی همچون ایمونوانفورماتیک که از علم بیوانفورماتیک گسترش پیدا کرده اند، کار طراحی واکسن متوحل شده است.
پس از پاندمی که از سال 2019 شروع شد صنعت واکسن سازی به مرحله ی جدیدی وارد شد و امروزه علاوه بر تلاش برای ساخت واکسن بیماری های عفونی همچون ابلا ویروس و کرونا ویروس، تلاش هایی در جهت ساخت واکسن برای بیمارهای مضمن در جریان است.
انواعی از سرطان ها و بیماری های عصبی همچون آلزایمر و پارکینسون از جمله بیماری های غیر میکروبی هستند که توجه واکسن سازان را به خود جلب کرده و نظام سلامت کشور ها روی درمان این بیماری ها از طریق واکسن درحال سرمایه گذاری است.
روش های طراحی واکسن در گروه وانیار
در شرایط کنونی می توان با استفاده از تکنیک های بیوانفورماتیک یک سازه ی زیستی مالتی اپی توپ (Multi Epitope) را تولید کرد که توانایی تحریک سلول های B و سلولی های T بدن را به صورت همزمان داشته باشد.
گروه بیوانفورماتیک وانیار با بهره گیری از کارشناسان با تجربه در زمینه بیوانفورماتیک این امکان را برای محققین و صنعتگران عرصه بیوتکنولوژی فراهم آورده که پروژه های طراحی واکسن خود را در مرحله in silico با دقت بالایی به انجام برسانند.
پروژه های طراحی واکسن در گروه وانیار به سه شکل کلی انجام می شود: طراحی واکسن های پروتئینی، واکسن هایی بر پایه DNA و واکسن هایی بر پایه RNA.
Protein Base: در این نوع از طراحی واکسن در نهایت سازه ی واکسن به فرم یک پروتئین مهندسی شده خواهد بود.
DNA Base: در این نوع از طراحی واکسن در نهایت یک ساختار DNA نوترکیب وجود دارد که برای انتقال به وکتور های ویروسی نیازمند می باشد.
RNA Base: در این نوع از طراحی واکسن در نهایت یک ساختار mRNA وجود دارد که برای انتقال به وکتور هایی از نانوذرات طلا و یا وکتور های ویروسی نیازمند است.
مراحل ثبت پروژه طراحی واکسن در پیشخوان:
گروه بیوانفورماتیک وانیار امکان طراحی واکسن های نسل جدید با روش های بیوانفورماتیکی را زیر نظر کارشناسان بیوانفورماتیک فراهم کرده است.
برای درخواست گردش کار طراحی واکسن مراحل زیر را دنبال کنید:
- ابتدا وارد پیشخوان خود در سایت وانیار شوید(در صورتی که در سایت ثبت نام نکرده اید از بالای صفحه روی دکمه ثبت نام زده و در چند لحظه ثبت نام خود را کامل کنید.)
- از بخش پشتیبانی یک تیکت طراحی واکسن با توضیحات کامل در مورد پروژه به بخش بیوانفورماتیک ساختاری ارسال نمایید.
- کارشناس بیوانفورماتیک توضیحات و مشاوره مورد نیاز را به شما خواهد داد.
- پلن خود را در پیشخوان ثبت سفارش کنید.
- پس از اتمام پروژه گزارش کامل به همراه فایل های پیوست شده در پیشخوان وانیار قابل دریافت می باشد.
- هدف ما ارائه خدمات مطلوب و باکیفیت در کوتاه ترین زمان ممکن است.
پلن های طراحی واکسن در گروه وانیار
برای انتخاب هر یک از پلن های طراحی واکسن پس از کلیک بر روی دکمه «درخواست این پلن» به بخش پشتیبانی وانیار وارد می شوید، تکت پشتیبانی ارسال نمایید تا کارشناسان بیوانفورماتیک وانیار مشاوره لازم برای ثبت سفارش پلن های طراحی واکسن را به شما ارائه نمایند.
پلن DNA Vaccine
مناسب طراحی DNA واکسن-
بررسی ژنوم ارگانیسم
-
انتخاب پروتئین های مناسب
-
تعیین اپی تپ لنفوسیت های T
-
تعیین اپی تپ لنفوسیت های B
-
Vaccine construction
-
پیش بینی Antigenicity
-
پیش بینی Allergenicity
-
بررسی خواص فیزیکوشیمیای
-
پیش بینی ساختار دوم
-
پیش بینی ساختار سوم
-
ارزیابی ساختار سوم
-
بهبود ساختار سوم
-
Protein-Protein Docking
-
in silico cloning
-
گزارش کارشناس بیوانفورماتیک
پلن Protein Vaccine
مناسب طراحی پروتئین واکسن-
بررسی ژنوم ارگانیسم
-
انتخاب پروتئین های مناسب
-
تعیین اپی تپ لنفوسیت های T
-
تعیین اپی تپ لنفوسیت های B
-
Vaccine construction
-
پیش بینی Antigenicity
-
پیش بینی Allergenicity
-
بررسی خواص فیزیکوشیمیای
-
پیش بینی ساختار دوم
-
پیش بینی ساختار سوم
-
ارزیابی ساختار سوم
-
بهبود ساختار سوم
-
Protein-Protein Docking
-
-
گزارش کارشناس بیوانفورماتیک
پلن mRNA Vaccine
مناسب طراحی mRNA واکسن-
بررسی ژنوم ارگانیسم
-
انتخاب پروتئین های مناسب
-
تعیین اپی تپ لنفوسیت های T
-
تعیین اپی تپ لنفوسیت های B
-
Vaccine construction
-
پیش بینی Antigenicity
-
پیش بینی Allergenicity
-
بررسی خواص فیزیکوشیمیای
-
پیش بینی ساختار دوم
-
پیش بینی ساختار سوم
-
ارزیابی ساختار سوم
-
بهبود ساختار سوم
-
Protein-Protein Docking
-
mRNA construction
-
گزارش کارشناس بیوانفورماتیک